Использование машинного обучения для анализа липидного профиля среды культивирования и прогнозирования эффективности вспомогательных репродуктивных технологий

05/03/2025

На портале РОАГ размещена статья «Использование машинного обучения для анализа липидного профиля среды культивирования и прогнозирования эффективности вспомогательных репродуктивных технологий», опубликованная в № 2/2025 журнала «Акушерство и гинекология».

Драпкина Ю.С., Макарова Н.П., Чаговец В.В., Васильев Р.А., Амелин В.В., Калинина Е.А.
  1. ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И. Кулакова» Минздрава России, Москва, Россия;
  2. Лаборатория прикладного искусственного интеллекта Z-union, Москва, Россия
Результаты:
Ключевые слова: Машинное обучение, липидный профиль, среды культивирования, программы ВРТ, прогнозирование эффективности
Авторы:
Разработана модель ГБ для прогнозирования результатов ВРТ по липидному профилю среды культивирования. Модель позволяет с точностью 79% (f1 score: 0,81) выявлять липидный профиль среды культивирования с эмбрионами, подсадка которых завершилась наступлением беременности. Среди идентифицированных липидов культуральной среды, согласно построенной модели, наибольший вклад в определение имплантационного потенциала эмбриона вносят триацилглицерины.
Заключение:
Анализ данных ЖХ-МС с помощью метода ГБ позволяет выделить различные классы липидов в среде культивирования эмбриона, что может быть использовано в качестве неинвазивного подхода для оценки качества и имплантационного потенциала эмбриона, а также для создания прогностической тест-системы эффективности программы ВРТ.
Эта информация дает возможность более детального изучения механизмов повреждения гамет у пациентов с различными экстрагенитальными заболеваниями, а также может быть использована для разработки методов селективного переноса максимально перспективного эмбриона.
Материалы и методы:
В исследование были включены 60 супружеских пар, обратившихся за лечением бесплодия методом ВРТ. Пациенткам c трубно-перитонеальным фактором бесплодия, включенным в исследование, была выполнена овариальная стимуляция по протоколу с антагонистом гонадотропин-рилизинг-гормона. В день переноса эмбриона был проведен забор среды культивирования с последующей криоконсервацией образцов среды. Липидный профиль образцов был определен с помощью жидкостной хроматографии с масс-спектрометрическим детектированием (ЖХ-МС). Полученные данные были проанализированы с использованием ГБ.
Цель:
Разработать метод прогнозирования результата ВРТ на основании анализа профиля липидов среды культивирования эмбриона на 5-е сутки после оплодотворения с использованием градиентного бустинга (ГБ) и определить липиды, которые вносят наибольший вклад в прогнозирование.
Определение липидного профиля среды культивирования эмбриона является одним из современных и перспективных неинвазивных способов прогнозирования эффективности программы вспомогательных репродуктивных технологий (ВРТ). Использование методов машинного обучения для определения наиболее значимой группы липидов в среде культивирования позволяет обрабатывать нелинейные отношения в данных, а также извлекать наиболее информативные признаки из входных параметров.
Актуальность: