Подписаться на новости
Авторы
Сухих Г.Т., Шмаков Р.Г., Курцер М.А., Баринов С.В., Чупрынин В.Д., Михеева А.А., Амирасланов Э.Ю., Григорьян А.М., Коноплев Б.А., Кутакова Ю.Ю., Карапетян Т.Э., Васильченко О.Н., Забелина Т.М., Серова О.Ф., Пырегов А.В., Куликов И.А., Белоусова Т.Н., Плахотина Е.Н., Пенжоян Г.А., Макухина Т.Б., Андреева М.Д., Шаповалова О.А., Каменских Г.В., Лобач С.В., Позднякова Т.И., Савельева И.В., Бухарова Е.А., Носова Н.В., Цхай В.Б., Распопин Ю.С., Гарбер Ю.Г., Веккер И.Р., Журлова О.Н., Нечаева М.В., Белоконева Т.С., Протопопова Н.В., Дудакова В.Н., Новичков Д.А., Хворостухина Н.Ф., Владимирова Н.Ю., Федорова К.В., Ринчиндоржиева М.П., Тудупова Б.Б., Панова Т.В., Гусева О.И., Мануйленко О.В., Брум О.Ю., Дорфман О.В., Веровская Т.А., Бабаева Л.К., Рымашевский А.Н., Хвалина Т.В., Дмитриева С.Л., Горев С.Н., Малышкина А.И., Песикин О.Н., Зубенко В.Б., Лобач Н.В., Брюхачева Т.В., Караваева А.А., Беженарь В.Ф., Аракелян Б.В., Ральникова А.Ю., Курлеева Т.Ю., Вологодская Е.В., Дикарёва Л.В., Малышева И.П., Идам-Сюрюн А.М., Шакурова Е.Ю., Семёнов Ю.А., Шерстобитов А.В., Фортыгин А.Я., Зюзин Е.С., Кашлевская Н.Л., Шамина М.С., Густоварова Т.А., Хаванский В.А., Щегольков М.Е., Кулакова С.А., Клишина В.В.
- ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И. Кулакова» Минздрава России, Москва, Россия;
- ФГБОУ ВО «Российский научно-исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова» Минздрава России, Москва, Россия;
- Клинический госпиталь «Лапино» группы компаний «Мать и дитя» ООО «ХАВЕН», Московская область, Россия;
- ФГБОУ ВО «Омский государственный медицинский университет» Минздрава России, Омск, Россия;
- ГБУЗ МО «Московский областной перинатальный центр», Московская область, Россия;
- ГБУЗ МО «Видновский перинатальный центр», Московская область, Россия;
- ФГБОУ ВО «Кубанский государственный медицинский университет» Минздрава России, Краснодар, Россия;
- ГБУЗ «Краевая клиническая больница №2» Минздрава Краснодарского края, Краснодар, Россия;
- ГБУЗ «Кабардино-Балкарский республиканский перинатальный центр» Минздрава Кабардино-Балкарской Республики, Нальчик, Россия;
- ФГОУ ВО «Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого» Минздрава России, Красноярск, Россия;
- КБУЗ «Красноярский краевой клинический центр охраны материнства и детства», Красноярск, Россия;
- ГАУЗ «Оренбургская областная клиническая больница №2», Оренбург, Россия;
- ГБУЗ «Самарская областная клиническая больница имени В.Д. Середавина», Самара, Россия;
- Иркутская государственная медицинская академия последипломного образования – филиал ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России, Иркутск, Россия;
- ФГБОУ ВО «Саратовский государственный медицинский университет имени В.И. Разумовского» Минздрава России, Саратов, Россия;
- КГБУЗ «Перинатальный центр имени профессора Г.С. Постола» Минздрава Хабаровского края, Хабаровск, Россия;
- ГАУЗ «Республиканский перинатальный центр» Минздрава Республики Бурятия, Улан-Удэ, Россия;
- ГБУЗ НО «Городская клиническая больница №40 Областной перинатальный центр», Нижний Новгород, Россия;
- ФГБОУ ВО «Приволжский исследовательский медицинский университет» Минздрава России, Нижний Новгород, Россия;
- ГБУЗ НО «Городская клиническая больница №40», Нижний Новгород, Россия;
- ГБУЗ «Забайкальский краевой перинатальный центр», Чита, Россия;
- ГБУЗ «Волгоградский областной клинический перинатальный центр №2», Волгоград, Россия;
- ФГБОУ ВО «Ростовский государственный медицинский университет» Минздрава России, Ростов-на-Дону, Россия;
- ГБУ РО «Перинатальный центр», Ростов-на-Дону, Россия;
- КОГБУЗ «Кировский областной клинический перинатальный центр», Киров, Россия;
- ФГБОУ ВО «Кировский государственный медицинский университет» Минздрава России, Киров, Россия;
- ФГБУ «Ивановский научно-исследовательский институт материнства и детства имени В.Н. Городкова» Минздрава России, Иваново, Россия;
- ФГБОУ ВО «Ивановская государственная медицинская академия» Минздрава России, Иваново, Россия;
- ГБУЗ СК «Ставропольский краевой клинический перинатальный центр», Ставрополь, Россия;
- Перинатальный центр БУЗ УР «Первая республиканская клиническая больница» Минздрава Удмуртской Республики, Ижевск, Россия;
- ФГБОУ ВО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И.П. Павлова» Минздрава России, Санкт-Петербург, Россия;
- ГБУЗ «Приморский краевой перинатальный центр», Владивосток, Россия;
- ФГБУ ВО «Астраханский государственный медицинский университет» Минздрава России, Астрахань, Россия;
- Областной перинатальный центр ГБУЗ АО «Александро-Мариинская областная клиническая больница», Астрахань, Россия;
- ГБУЗ РТ «Перинатальный центр Республики Тыва», Кызыл (Республика Тыва), Россия;
- ГБУЗ РК «Республиканский перинатальный центр имени К.А. Гуткина», Петрозаводск, Россия;
- ГБУЗ «Областной перинатальный центр», Челябинск, Россия;
- Перинатальный центр ГБУЗ «Пензенская областная клиническая больница имени Н.Н. Бурденко», Пенза, Россия;
- ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Минздрава России, Смоленск, Россия;
- ГБУЗ РМ «Мордовская республиканская центральная клиническая больница», Саранск, Россия;
- ГУЗ «Липецкий областной перинатальный центр», Липецк, Россия;
- ОГБУЗ «Белгородская областная клиническая больница Святителя Иоасафа», Белгород, Россия;
- ГОБУЗ «Новгородский областной клинический перинатальный центр имени В.Ю. Мишекурина», Великий Новгород, Россия
Сравнительный анализ степени надежности данных о молекулярном кариотипе эмбриона, получаемых методами полногеномной амплификации на основе технологии секвенирования следующего поколения (NGS) отдельных клеток трофэктодермы
18/07/2024
На портале РОАГ размещена статья «Сравнительный анализ степени надежности данных о молекулярном кариотипе эмбриона, получаемых методами полногеномной амплификации на основе технологии секвенирования следующего поколения (NGS) отдельных клеток трофэктодермы», опубликованная в № 6/2024 журнала «Акушерство и гинекология».
Глотов О.С., Сайфитдинова А.Ф., Павлова О.А., Леонтьева О.А., Полякова И.В., Масленников А.Б.
- ФГБУ «Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства», Санкт-Петербург, Россия;
- ООО «Сербалаб», Санкт-Петербург, Россия;
- ФГБНУ «Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта», Санкт-Петербург, Россия;
- ФГБОУ ВО «Российский государственный педагогический университет им. А.И. Герцена», Санкт-Петербург, Россия;
- 5АО «Международный центр репродуктивной медицины», Санкт-Петербург, Россия;
- ООО «Бигль», Санкт-Петербург, Россия;
- ГБУЗ Новосибирской области «Городская клиническая больница № 1», Новосибирск, Россия
Ключевые слова: полногеномная амплификация, WGA, высокопроизводительное секвенирование, NGS, преимплантационное генетическое тестирование, ПГТ, секвенирование отдельных клеток, WGA Display, SurePlex DNA Amplification System
Авторы:
Анеуплоидии у эмбрионов человека вносят существенный вклад в этиологию неудач имплантации и ранних репродуктивных потерь в программах вспомогательных репродуктивных технологий (ВРТ). Наиболее распространенным методом оценки плоидности эмбриона является преимплантационное генетическое тестирование на анеуплоидии (ПГТ-А). Внедрение ПГТ-А в клиническую практику позволило значительно снизить вероятность переноса анеуплоидного эмбриона в полость матки и повысить эффективность программ ВРТ.
Существуют преимущества и недостатки различных методов ПГТ-А и способов забора материала для анализа, а также имеется ряд причин возможных ложноположительных и ложноотрицательных результатов ПГТ-А. Поскольку для исследования берется всего несколько клеток, большое значение для получения достоверных результатов анализа имеет равномерность амплификации ДНК; в связи с чем ключевым и самым важным этапом ПГТ-А является полногеномная амплификация ДНК (whole genome amplification, WGA).
Существуют преимущества и недостатки различных методов ПГТ-А и способов забора материала для анализа, а также имеется ряд причин возможных ложноположительных и ложноотрицательных результатов ПГТ-А. Поскольку для исследования берется всего несколько клеток, большое значение для получения достоверных результатов анализа имеет равномерность амплификации ДНК; в связи с чем ключевым и самым важным этапом ПГТ-А является полногеномная амплификация ДНК (whole genome amplification, WGA).
В статье приведен анализ современных данных литературы, посвященной исследованию оценки эффективности и надежности методов масштабирования малых количеств ДНК; приведены результаты собственного исследования по сравнительному анализу методов полногеномной амплификации отдельных клеток трофэктодермы с целью получения надежных данных о молекулярном кариотипе эмбриона методом NGS. Показана эффективность использования отечественных наборов WGA.
Заключение:
Сравнение результатов ПГТ-А с использованием различных наборов показало применимость разработанного нами «гибридного» протокола, где могут использоваться как зарубежные наборы для полногеномной амплификации, так и отечественные. Данный подход показал высокую надежность наборов WGA с SD-полимеразой для подготовки материала к проведению ПГТ эмбрионов человека, а также может найти применение в других областях биомедицины и судебно-медицинских исследований, где востребована высокая надежность и точность амплификации предельно малых количеств ДНК.