В. И. Кулаков внес огромный научный вклад в решение актуальнейших проблем акушерства, гинекологии и неонатологии.

Это и борьба с бактериально-вирусной инфекцией в акушерстве и неонатологии, и решение проблем невынашивания беременности и выхаживания новорожденных, сохранение репродуктивной функции и ее восстановление при бесплодии, разработка вспомогательных репродуктивных технологий, в результате внедрения которых в России родился первый ребенок «из пробирки».

Одним из важных аспектов научно-практической деятельности В. И. Кулакова явилось совершенствование эндоскопических хирургических вмешательств, оказание высокоспециализированной хирургической помощи новорожденным с ВПР в первые месяцы жизни, совершенствование анестезиологической и реанимационной служб в акушерстве и гинекологии. По инициативе В. И. Кулакова была начата разработка нового перспективного направления — внутриутробной терапии плода, позволяющая корригировать некоторые врожденные и наследственные дефекты его развития.

Широкое признание получила профессиональная общественная деятельность В. И. Кулакова. Многие годы он был главным акушером-гинекологом Минздрава России, вице-президентом РАМН, председателем межведомственного научного совета РАМН по акушерству и гинекологии, экспертного Совета ВАК по хирургическим наукам, президентом Российского общества акушеров-гинекологов.

Академик В. И. Кулаков создал школу акушеров-гинекологов хирургов, ученики которой занимают ведущие позиции по специальности в стране.